Profil

Madrasah Aliyah Negeri Balikpapan merupakan satu-satunya MA Negeri di antara 7 MA Swasta yang ada di Kota Balikpapan. Sebelumnya MAN Balikpapan bernama MAN 2 Samarinda Filial Balikpapan. MAN 2 Samarinda Filial Balikpapan ini didirikan tahun 1991 hingga 1995. Keberadaan Madrasah Aliyah Negeri di Kota Balikpapan tidak terlepas dari jasa para pengurus Yayasan Ash-Shalihin pada waktu itu. Pengurus yayasan tersebut di antaranya adalah :

1. Drs.H.Abdul MuisAbdullah,
2. Drs.H.Yusri Idris,
3. Drs.H. MuhammadKusasi, M.Pd 

Pada Awal berdirinya MAN ini menempati gedung Mts Negeri1 Balikpapan di Kelurahan Muara Rapak Balikpapan tahun 1991 s.d 1992. Setelah hampir dua tahun MA pindah di jalan Prapatan yang menempati gedung eks. SD dan SMP Cempaka yang dihibahkan oleh ke Pemerintah Kota Balikpapan.

Periodesasi Kepala Madrasah Aliyah Negeri Balikpapan :

1. DR.H. Muhammad Kusas,M.Pd ( Tahun 1991 s/d Tahun 2002)  

2. Drs H. Murdjani Wahab (Tahun 2002 s/d Tahun 2013)

3. Drs.H.Ismail Mahlan, M.Ag (Tahun 2013 s/d Tahun 2015)

4. DR. Drs. H Sartono, MM (Tahun 2015 s/d Tahun 2018)

5. Sahri Romadi, M.Pd (Tahun 2018 s/d Tahun 2021)

6. Hj, Roihanun, S.Pd.,M.Pd (Tahun 2021 s/d Sekarang)

Sejak tahun 2019, MAN Balikpapan mengalami pengembangan signifikan dengan bertambahnya gedung untuk kegiatan pembelajaran, berupa pembangunan gedung berasrama dan gedung kelas yang berlokasi di Jalan Padat Karya KM 8,5, Kelurahan Graha Indah, Kecamatan Balikpapan Utara. Pembangunan ini bertujuan untuk meningkatkan daya tampung peserta didik serta mendukung pembinaan akademik dan karakter secara lebih optimal.